Если ты нашел на компе вирус - это не значит, что он в одном файле. И потому, если извне систему полечить нельзя (а именно так чиститься система) я делаю следующее:
1. форматирование системного диска.
2. установка винды.
3. установка сетевых дров.
4. установка антивируса.
5. обновление антивируса.
5. проверка всей системы.
6. установка дров.
7. все остальное.